Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML2Q9UQR0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms