Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMC3Q9UQE7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms