Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS3Q9UPU3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS3Q9UPU3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms