Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHF8Q9UPP1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHF8Q9UPP1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms