Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC12A4Q9UP95 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.7 ms