Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRQQ9UMZ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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