Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FBXL3Q9UKT7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL3Q9UKT7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms