Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNL1Q9UK58 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNL1Q9UK58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNL1Q9UK58 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms