Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3LQ9UJW3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3LQ9UJW3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms