Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL4Q9UJQ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL4Q9UJQ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms