Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO3A1Q9UIG8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms