Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms