Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX25Q9UHL0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms