Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF20Q9UGU0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF20Q9UGU0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms