Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA9Q9UGM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA9Q9UGM1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA9Q9UGM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNA9Q9UGM1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms