Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5BQ9UGL1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KDM5BQ9UGL1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.81■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5BQ9UGL1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms