Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA6Q9UF33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms