Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NKX1-2Q9UD57 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.9 ms