Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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