Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRNQ9P2B2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRNQ9P2B2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGFRNQ9P2B2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRNQ9P2B2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms