Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CCDC180Q9P1Z9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms