Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP1Q9P0U3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SENP1Q9P0U3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms