Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCMF1Q9P0J7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms