Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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