Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF12Q9NZN5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF12Q9NZN5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms