Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms