Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms