Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms