Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNTLNQ9NXG0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNTLNQ9NXG0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms