Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms