Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT13Q9NUP7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT13Q9NUP7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms