Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZCCHC3Q9NUD5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZCCHC3Q9NUD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms