Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RRP7BPQ9NSQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRP7BPQ9NSQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms