Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN1Q9NS71 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms