Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP2Q9NS61 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms