Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBP3Q9NS15 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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