Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms