Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR9Q9NR96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR9Q9NR96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms