Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BIN3Q9NQY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms