Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPNPEP3Q9NQH7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms