Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4BQ9NPR2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms