Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPCPD1Q9NPB8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms