Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
POLMQ9NP87 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLMQ9NP87 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms