Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGAP3Q9NP61 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP3Q9NP61 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP3Q9NP61 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms