Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG7

GBA2, Non-lysosomal glucosylceramidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBA2Q9HCG7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBA2Q9HCG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GBA2Q9HCG7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms