Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUDS3Q9H7L9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUDS3Q9H7L9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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