Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRABDQ9H4I3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRABDQ9H4I3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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