Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHOJQ9H4E5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOJQ9H4E5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms