Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC8Q9H0W5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms