Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NBPF3Q9H094 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF3Q9H094 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms